民航醫學中心（民航總醫院）始建于1982年，于2010年重新整合為民航醫學中心，包括民航總醫院、民用航空醫學研究所、民用航空人員體檢鑒定所和航空醫學系培訓部，是一所設備先進、科室齊全、服務優良、集醫教研防于一體、具有航空醫學特色的三級綜合醫院，也是全國民航唯一一所三級醫院，同時承擔著全國民航系統空勤人員體檢鑒定、航空醫學研究及民航體檢鑒定醫師培訓工作。
醫院位于北京市朝陽區東部，北臨朝陽路、南鄰京通快速路和地鐵八通線，地理位置優越。醫院占地面積5萬平方米，總建筑面積16萬平方米，新建航空醫學大樓即將投入使用，開放床位達到1000余張。目前醫院在職職工1300余人，設有15個病區、31個臨床醫技科室，在心血管疾病介入治療、血液透析及血液凈化、高危妊娠診治、椎間盤突出治療和關節置換、腹腔鏡微創手術、前列腺疾病的治療等方面具有先進水平。內科設有8個專業：心血管內科、呼吸內科、消化內科、神經內科、腎內科、內分泌科、血液腫瘤科、老年病科；外科7個專業：普外科、肝膽外科、骨科、泌尿外科、神經外科、心胸外科、整形外科；婦產科8個專業：婦科、產科、計劃生育、生殖健康與不孕癥、優生學、婦女保健、圍產期保健、更年期保健；兒科9個專業：小兒消化、小兒呼吸、小兒心臟病、小兒腎病、小兒血液病、小兒內分泌、小兒傳染病、小兒遺傳病；眼科、耳鼻咽喉頭頸外科、口腔科、皮膚科、中醫科、感染疾病科、急診科、麻醉科、疼痛科、康復理療科等科室也均設有相應的亞專業；醫技科室8個，包括放射科、核醫學科、檢驗科、藥劑科、物理診斷科、病理科、高低壓氧科等科室。設有1.5T核磁、64排CT、數字化減影血管造影機、SPECT、高低溫高低壓一體氧艙、層流手術室等大型醫療設備設施。多個科研項目獲批民航局級科研課題立項，并獲得首發基金和國家自然科學基金、北京市自然科學基金的資助。醫院為首都文明單位，全國百姓放心示范醫院，中央國家機關平安單位，首都平安示范醫院。
醫院是通過國家教育部評估的北京大學臨床教學醫院，一直承擔著北京大學醫學部臨床醫學專業本科生、研究生的教學和臨床實習工作，其中心血管內科、耳鼻咽喉頭頸外科、婦產科B超、檢驗科、內分泌科是北京大學醫學部碩士研究生培養點，外科、內科是北京市住院醫師規范化培訓基地，透析中心是北京市透析技術培訓基地，婦產科和放射科是朝陽區孕產婦急救網絡產科出血定點救治中心，各學科在相應的領域均發揮著重要的作用。
中心是國際航空航天醫學會委員單位，下設的民用航空人員體檢鑒定所是全民航唯一一家航空人員三級體檢鑒定機構，是全國民航航空人員體檢鑒定醫師培訓基地，肩負著保障航空人員健康，完善中國航空醫學體系建設，保障民航飛行安全的重任，承擔著全民航特許鑒定飛行及延飛任務。航空醫學研究所負責全民航航空人員心理測試及藥品檢測、航空環境衛生及有害生物檢測，其中航空毒理藥理和航空衛生環境兩個實驗室獲得了國家級認可（CNAS）和實驗室認證（CMA）。目前在研課題13項，在研項目經費已經達到了一千余萬元，擁有國家級先進實驗室設備和設施，擁有一支非常專業、高素質的研究隊伍。
“服務民航，面向社會”是我們的宗旨。多年來，我們一直倡導“醫院發展以員工為中心，醫療服務以病人為中心”的辦院理念，始終堅持“以普通醫學為基礎，以航空醫學為引領”的發展方向，努力打造作風過硬、素質精良的醫護團隊，塑造以人為本、優質高效的服務品牌，以精益求精的態度和無私博愛的胸懷，向一流隊伍、一流管理、一流技術、一流服務的現代化綜合醫院和具有國際水平的中國民用航空醫學中心的奮斗目標邁進。
